Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PctpP53808 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
PctpP53808 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
PctpP53808 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
PctpP53808 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms