Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LtbrP50284 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LtbrP50284 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LtbrP50284 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms