Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Tmod1P49813 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Tmod1P49813 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms