Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ercc3P49135 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms