Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Cox8bP48772 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms