Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd4P46935 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms