Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkn1bP46414 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms