Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Syt1P46096 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Syt1P46096 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syt1P46096 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms