Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

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Length 495 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gdf5P43027 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gdf5P43027 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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