Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

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Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprkP35822 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprkP35822 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprkP35822 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms