Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

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Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nedd1P33215 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nedd1P33215 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Nedd1P33215 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nedd1P33215 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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