Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Dusp1P28563 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms