Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Gjb1P28230 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Gjb1P28230 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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