Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
U2af2P26369 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
U2af2P26369 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
U2af2P26369 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
U2af2P26369 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms