Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Hoxd12P23812 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms