Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Eif3aP23116 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Eif3aP23116 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms