Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Tnnc1P19123 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms