Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18525 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18525 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18525 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18525 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18525 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18525 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18525 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18525 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18525 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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