Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gabra6P16305 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gabra6P16305 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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