Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Dnmt3cP0DOY1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms