Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb1P09055 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb1P09055 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms