Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 AC162940.1-201ENSMUST00000224745 1167 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Hoxd3P09027 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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