Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Spta1P08032 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Spta1P08032 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms