Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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P06344 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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P06344 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06344 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06344 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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P06344 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06344 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06344 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06344 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06344 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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P06344 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P06344 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P06344 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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P06344 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06344 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06344 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P06344 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P06344 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms