Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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H2-Eb1P04230 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2-Eb1P04230 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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