Protein–RNA interactions for Protein: P01820

Ig heavy chain V region PJ14, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01820 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01820 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01820 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01820 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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