Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01789 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01789 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01789 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01789 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms