Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CcnkO88874 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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CcnkO88874 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CcnkO88874 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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