Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lnx1O70263 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lnx1O70263 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms