Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ldb2O55203 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ldb2O55203 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ldb2O55203 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Ldb2O55203 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ldb2O55203 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
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Ldb2O55203 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ldb2O55203 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms