Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Sp100O35892 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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