Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Dgcr6O35347 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Dgcr6O35347 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms