Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Ptpn9O35239 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ptpn9O35239 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms