Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ebi3O35228 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.9 ms