Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Sec22bO08547 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Sec22bO08547 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms