Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm20878L7N244 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms