Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm8356J3QPD3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms