Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm5294J3QP53 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm5294J3QP53 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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