Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm21900J3QP38 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm21900J3QP38 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21900J3QP38 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21900J3QP38 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21900J3QP38 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21900J3QP38 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21900J3QP38 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm21900J3QP38 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm21900J3QP38 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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