Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc180J3QNE4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc180J3QNE4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
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