Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
E030018B13RikJ3QMS9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms