Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm28048F7BCN0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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