Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm28305F6U473 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm28305F6U473 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm28305F6U473 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28305F6U473 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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