Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gm21977F6U3N7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms