Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc146E9Q9F7 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc146E9Q9F7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms