Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms