Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm17727E9Q4V7 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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Gm17727E9Q4V7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Gm17727E9Q4V7 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm17727E9Q4V7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
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