Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fndc1E9Q043 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms