Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc8E9PWG2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc8E9PWG2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms