Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms